《超级伙伴》讲述了一名叫夏天的五年级小学生的传奇经历，夏天有了两个新邻居，他们是代博士和他的儿子金刚。在认识他们之后，一系列的怪事发生了，在高度发达的人类的科学技术中，时间可以逆转，思维传输也不是什么难题。在传输夏天思维的过程中出现了事故。夏天的思维被分离了。善良与邪恶被分别传输到了金刚和元一的身体里，在将近30年的痛苦中，夏天的邪恶被释放了出来，成为了想要毁灭世界的元一。而夏天的善良也被分离出来就是金刚。代博士和金刚来到现在，就是要阻止火灾，改变历史，最终的时刻元一来到现在，他不允许历史改变。应为历史改变他就不复存在了。最后在夏天、金刚、代博士等的齐心协力的努力下，打败了元一。